En aquesta ocasió el protagonista viatja, al costat de la Princesa Selenia i el seu germà Betameche, a la recerca de la ciutat prohibida de Necròpolis, llar del malvat bruixot Maltazard. “Ajuda!” Aquest crit d’alarma inscrit en un gra d’arròs i deixat per una aranya missatgera posa a Arthur en alerta: “Els Minimoys estan en perill. No hi ha ni un segon que perdre!”. Just en aquest moment el pare d’Arthur decideix partir abans del previst, i espera impacient al volant del seu cotxe. Arthur té el temps just per prevenir el seu avi Archibald perquè acudeixi a la crida d’auxili en el seu lloc … però imaginar Sélénia en perill és difícil de suportar. Amb la complicitat del seu gos Alfred, Arthur enganya la vigilància dels seus pares i torna en plena nit a la casa dels seus avis. No obstant això, un núvol s’aproxima perillosament a la lluna a la mitjanit, l’hora en què els seus raigs han d’assolir el telescopi d’Archibald i obrir la porta cap al món dels Minimoys.