La nova missió de l’agent especial Ethan Hunt consisteix a impedir que un despiadat exagent que s’ha convertit en terrorista internacional s’apoderi d’un virus mortal i l’introdueixi a Austràlia causant milions de víctimes. Per això, compta de nou amb la inestimable ajuda del geni informàtic Luther Stickell, amb l’expert conductor Billy Baird i amb la sensual i exòtica lladre internacional Nhye, que va mantener una relació sentimental amb el terrorista, però que ara es sent atraida per  Hunt.